Quando l’amato nonno lascia a Jake indizi su un mistero che attraversa mondi e epoche, il ragazzo si ritroverà in un luogo magico noto come La Casa per Bambini Speciali di Miss Peregrine.
Il mistero si infittisce ulteriormente quando Jake conoscerà gli abitanti della casa, i loro poteri speciali … e i loro potenti nemici. Alla fine scoprirà che solo la sua "peculiarità" potrà salvare i suoi nuovi amici.